charming

① housekeeping gene을 넣은 그룹을 기준으로 잡는다.

(프로그램 설정 시 Reference sample은 negative control sample, endogenous control은 housekeeping gene을 넣는다)

② housekeeping gene의 CT값을 사용해 각 그룹의 CT값에서 dCT를 구한다.

dCT= CT(gene)-CT(B-actin 같은 control)

③ housekeeping gene을 넣은 control 그룹의 값을 뺀다.

ddCT= dCT (실험군) - dCT (negative control, 여기서는 MSC)

실험 그룹은 N.C 그룹보다 CT값이 작으므로 -값이, housekeeping gene 그룹은 0값이 나온다.

④ 2^(-ddCt)(=RQ)의 값을 구한다(이때 housekeeping gene 그룹의 값은 0이므로 2^(-ddCt)의 값은 1이 된다)

⑤ RQ값을 이용해 그래프를 그린다.

image를 찍은 후, 알고 있는 unit 단위에 맞춰 분석하고자 할 때 다음 방법을 사용할 수 있다.

이 방법을 사용하기 위해서는 scale bar가 필요하다. 

① image J 프로그램을 실행한다.

② file-open으로 이미지를 열거나, ctr +c,v로 이미지를 연다.

③ 직선 모양을 클릭한다.

④ 이미지의 scale bar의 길이에 맞춰 선을 긋는다.

⑤ analyze - set scale을 클릭해 다음 창이 뜨게 한다.

⑥ known distance에 알고 있는 길이를, unit of length에 단위를 입력한다.

⑦ 이미지에서 측정하고자 하는 곳을 선을 긋는다.

⑧ 키보드의 m 버튼을 누른다. 다음과 같이 result 창이 뜬다.