1. 프로그램 사용하기

 pcr 프로그램상에서 나오는 RQ값을 바로 이용해 그래프를 만들 수 있다.

 

2. 계산식을 통해 RQ값 얻기

① 프로그램상에서 나온 data를 엑셀로 옮긴다.

(여기서 사용하는 값은 CT mean)

 

② 각각 sample에서 housekeeping gene의 CT값을 빼서 dCT의 값을 구한다.

(MSC는 MSC의 B-actin, DF는 DF의 B-actin값을 빼야 함)

MSC aSMA CT mean - MSC b-actin CT mean DF  DF aSMA CT mean - DF b-actin CT mean

③ 실험한 그룹의 dCT값에서 control 그룹의 dCT값을 빼 ddCT값을 얻는다.

(MSC는 control group이기 때문에 ddCT의 값이 0이 된다)

④ 2^(-ddCT)식을 이용해 RQ값을 구한다. 프로그램으로 구해진 RQ값과 동일한 것을 확인할 수 있다.

⑤ RQ값으로 그래프를 그린다.

 

'protocol' 카테고리의 다른 글

PCR 조건잡기  (0) 2019.05.08
PCR 결과로 그래프 만들기  (0) 2019.05.08
media change(부유 세포)  (0) 2018.03.07
media change(부착 세포)  (0) 2018.03.07
cell thawing  (0) 2018.03.07

+ Recent posts